В процессе работы с панелью ISP manager можно столкнуться с тем, что процесс bin/core ispmgr начинает жрать IO в немереных количествах. В моем случае на непродолжительное время помог рестарт панели:
/usr/local/mgr5/sbin/mgrctl -m ispmgr exit
Однако через время проблемы с диском возвращались и тогда помогло:
killall -s 9 core
По всей видимости обычный рестарт не помогает в данном случае.